转业后的马治军任榆林军旅文化园董事长，在自己的企业内安置下岗职工、城乡待业青年累计达一千多人，以此带动父老乡亲共同致富。多年来，他积极响应国家号召，参与扶贫工作，为榆林市榆阳区上盐湾乡、刘千河乡的一些贫困村捐资助力。每年捐资赞助邻村庙会，丰富村民的精神文化生活。多年来，他先后为贫困村、贫困户捐款捐物累计达280多万元，成为家乡人民和广大青少年学习的榜样。

马治军积极支持部队建设，继承和发扬双拥优良传统，经常组织员工慰问与驻榆部队，坚持帮助因公、因战伤残以及家庭困难的退伍军人和烈士亲属。2016年、2017年出资7万多元帮助陕西省咸阳市山丹丹爱国拥军协会持续发展；2018年资助南泥湾精神研究会3万元，促使南泥湾先进思想同双拥事业的有效结合。

三十年来，马治军凭着一颗赤子之心，以中国特色社会主义理论为指导，把“老山精神”传播到社会的各个层面，先后受邀给部队官兵、政府机关、企事业单位、大中小学校作英模报告140多场，受教育者达10万多人。

2015年，他被榆林市委、市政府授予“爱国拥军模范”荣誉称号；2016年7月，荣获《中国双拥》年度人物提名奖；2017年8月，荣获陕西省首届“最美老班长”荣誉称号；2018年6月，被中国人民解放军61150部队政治工作部特聘为“红色基因代代传工程”课外辅导员；2018年11月，被中国人民解放军71897部队政治工作部聘为“沙家浜红色基因宣讲员”；2018年11月，被陕西省南泥湾精神研究会评为“2018年度捐助学术研究工作先进个人”。